El temple de Kom Ombo no té ni propiló ni dromos, i al pòrtic hi ha 15 columnes (de les que se'n conserven 13 de dretes). Té dues entrades principals.
Una inscripció recorda la seva construcció o potser restauració per Ptolomeu VI Filometor i la seva dona i germana Cleòpatra al segle II aC. El temple es troba en un turonet. El cocodril fou especialment honorat a Kom Ombos i a les catacumbes s'han trobat mòmies d'aquestos animals sagrats. El cap del déu cocodril Sobek apareix a les monedes romanes de la ciutat.
